- a -

• advflux_reg : REMORA

- b -

• bndry_output_planes_interval : REMORA
• bndry_output_planes_per : REMORA
• bndry_output_planes_start_time : REMORA
• boxes_at_level : REMORA

- c -

• cfl : REMORA
• change_max : REMORA
• check_file : REMORA
• check_int : REMORA
• column_file_name : REMORA
• column_interval : REMORA
• column_loc_x : REMORA
• column_loc_y : REMORA
• column_per : REMORA
• cons_names : REMORA
• cons_new : REMORA
• cons_old : REMORA
• coriolis_beta : SolverChoice
• coriolis_f0 : SolverChoice
• coriolis_type : SolverChoice
• coupling_type : SolverChoice

- d -

• d_havg_density : REMORA
• d_havg_pressure : REMORA
• d_havg_temperature : REMORA
• data : NDArray< DataType >
• datalog : REMORA
• datalogname : REMORA
• derived_names : REMORA
• dimid : ncutils::NCDim
• do_substep : REMORA
• domain_bc_type : REMORA
• domain_bcs_type : REMORA
• domain_bcs_type_d : REMORA
• dt : REMORA

- f -

• fine_mask : REMORA
• fixed_dt : REMORA
• fixed_fast_dt : REMORA
• fixed_ndtfast_ratio : REMORA
• flat_bathymetry : SolverChoice

- g -

• g : SolverChoice

- h -

• h_havg_density : REMORA
• h_havg_pressure : REMORA
• h_havg_temperature : REMORA
• Hadv_scheme : SolverChoice

- i -

• ic_bc_type : SolverChoice
• init_shrink : REMORA
• input_bndry_planes : REMORA
• input_sounding_file : REMORA
• Int : ncutils::NCDType
• is_open : ncutils::NCFile
• istep : REMORA

- l -

• last_check_file_step : REMORA
• last_plot_file_step_1 : REMORA
• last_plot_file_step_2 : REMORA

- m -

• m_bc_extdir_vals : REMORA , REMORAPhysBCFunct
• m_data : TimeInterpolatedData
• m_domain_bcs_type : REMORAPhysBCFunct
• m_domain_bcs_type_d : REMORAPhysBCFunct
• m_geom : REMORAPhysBCFunct
• m_lev : REMORAPhysBCFunct
• m_owns_data : TimeInterpolatedData
• m_time : TimeInterpolatedData
• mapfac_m : REMORA
• mapfac_u : REMORA
• mapfac_v : REMORA
• max_step : REMORA

- n -

• name : NDArray< DataType >
• nc_bdry_file : REMORA
• nc_grid_file : REMORA
• nc_init_file : REMORA
• ncid : ncutils::NCDim , ncutils::NCGroup , ncutils::NCVar
• nfast : REMORA
• non_owning : TimeInterpolatedData
• nsubsteps : REMORA
• num_boxes_at_level : REMORA
• num_files_at_level : REMORA

- o -

• output_1d_column : REMORA
• output_bndry_planes : REMORA
• owned : NDArray< DataType >
• owning : TimeInterpolatedData

- p -

• phys_bc_type : REMORA
• physbcs : REMORA
• plot_file_1 : REMORA
• plot_file_2 : REMORA
• plot_file_on_restart : REMORA
• plot_int_1 : REMORA
• plot_int_2 : REMORA
• plot_var_names_1 : REMORA
• plot_var_names_2 : REMORA
• plotfile_type : REMORA
• pp_prefix : ParticleData , REMORA , SolverChoice
• previousCPUTimeUsed : REMORA

- r -

• R0 : SolverChoice
• rdrag : SolverChoice
• Real : ncutils::NCDType
• ref_counted : NDArray< DataType >
• ref_tags : REMORA
• regrid_int : REMORA
• restart_chkfile : REMORA
• rho0 : SolverChoice

- s -

• S0 : SolverChoice
• Scoef : SolverChoice
• shape : NDArray< DataType >
• solverChoice : REMORA
• spatial_order : SolverChoice
• sst : REMORA
• startCPUTime : REMORA
• stop_time : REMORA
• sum_interval : REMORA
• sum_per : REMORA

- t -

• T0 : SolverChoice
• t_new : REMORA
• t_old : REMORA
• tcline : SolverChoice
• Tcoef : SolverChoice
• theta_b : SolverChoice
• theta_s : SolverChoice
• tracer_particle_varnames : ParticleData
• tracer_particles : ParticleData

- u -

• use_baroclinic : SolverChoice
• use_barotropic : SolverChoice
• use_coriolis : SolverChoice
• use_prestep : SolverChoice
• use_salt : SolverChoice
• use_tracer_particles : ParticleData , REMORA
• use_uv3dmix : SolverChoice

- v -

• varid : ncutils::NCVar
• vec_Akt : REMORA
• vec_Akv : REMORA
• vec_bustr : REMORA
• vec_bvstr : REMORA
• vec_diff2 : REMORA
• vec_DU_avg1 : REMORA
• vec_DU_avg2 : REMORA
• vec_DV_avg1 : REMORA
• vec_DV_avg2 : REMORA
• vec_fcor : REMORA
• vec_hOfTheConfusingName : REMORA
• vec_Huon : REMORA
• vec_Hvom : REMORA
• vec_Hz : REMORA
• vec_pm : REMORA
• vec_pn : REMORA
• vec_rdrag : REMORA
• vec_rhoA : REMORA
• vec_rhoS : REMORA
• vec_ru : REMORA
• vec_rubar : REMORA
• vec_rufrc : REMORA
• vec_rv : REMORA
• vec_rvbar : REMORA
• vec_rvfrc : REMORA
• vec_rzeta : REMORA
• vec_s_r : REMORA
• vec_sstore : REMORA
• vec_sustr : REMORA
• vec_svstr : REMORA
• vec_ubar : REMORA
• vec_vbar : REMORA
• vec_visc2_p : REMORA
• vec_visc2_r : REMORA
• vec_visc3d_r : REMORA
• vec_weight1 : REMORA
• vec_weight2 : REMORA
• vec_x_r : REMORA
• vec_y_r : REMORA
• vec_z_phys_nd : REMORA
• vec_z_r : REMORA
• vec_z_w : REMORA
• vec_zeta : REMORA
• vec_Zt_avg1 : REMORA
• verbose : REMORA

- x -

• xvel_new : REMORA
• xvel_old : REMORA

- y -

• yvel_new : REMORA
• yvel_old : REMORA

- z -

• zvel_new : REMORA
• zvel_old : REMORA